Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3b2Q9JME5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms