Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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