Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rabgef1Q9JM13 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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