Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Mrpl39Q9JKF7 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms