Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ndufs3Q9DCT2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ndufs3Q9DCT2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ndufs3Q9DCT2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ndufs3Q9DCT2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ndufs3Q9DCT2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ndufs3Q9DCT2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms