Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms