Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 1700019C18Rik-203ENSMUST00000222085 1766 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gimd1-205ENSMUST00000212852 1234 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Tctex1d1-208ENSMUST00000223169 683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms