Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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