Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Swt1Q9DBQ9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Swt1Q9DBQ9 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Swt1Q9DBQ9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Swt1Q9DBQ9 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Swt1Q9DBQ9 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Swt1Q9DBQ9 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Swt1Q9DBQ9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Swt1Q9DBQ9 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Swt1Q9DBQ9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Swt1Q9DBQ9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Swt1Q9DBQ9 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Swt1Q9DBQ9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Swt1Q9DBQ9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Swt1Q9DBQ9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Swt1Q9DBQ9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms