Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
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