Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms