Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Pdzd9Q9D9M4 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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Pdzd9Q9D9M4 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Pdzd9Q9D9M4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Pdzd9Q9D9M4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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Pdzd9Q9D9M4 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Pdzd9Q9D9M4 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Pdzd9Q9D9M4 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Pdzd9Q9D9M4 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Pdzd9Q9D9M4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Pdzd9Q9D9M4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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Pdzd9Q9D9M4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Pdzd9Q9D9M4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Pdzd9Q9D9M4 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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Pdzd9Q9D9M4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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