Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms