Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms