Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Chmp4cQ9D7F7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Chmp4cQ9D7F7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Chmp4cQ9D7F7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Chmp4cQ9D7F7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Chmp4cQ9D7F7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Chmp4cQ9D7F7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Chmp4cQ9D7F7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Chmp4cQ9D7F7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Chmp4cQ9D7F7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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