Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gcc1Q9D4H2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcc1Q9D4H2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms