Protein–RNA interactions for Protein: Q9D328

Tmem35a, Transmembrane protein 35A, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35aQ9D328 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tmem35aQ9D328 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tmem35aQ9D328 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tmem35aQ9D328 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tmem35aQ9D328 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem35aQ9D328 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms