Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms