Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk1aQ9D132 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms