Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Zbed3Q9D0L1 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms