Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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