Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.5 ms