Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms