Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms