Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Atp6v0e1Q9CQD8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Atp6v0e1Q9CQD8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Atp6v0e1Q9CQD8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Atp6v0e1Q9CQD8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
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Atp6v0e1Q9CQD8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
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