Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Use1Q9CQ56 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms