Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms