Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim26Q99PN3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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