Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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