Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms