Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms