Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms