Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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