Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms