Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms