Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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Smim11aQ99J19 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Smim11aQ99J19 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Smim11aQ99J19 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Smim11aQ99J19 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Smim11aQ99J19 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Smim11aQ99J19 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Smim11aQ99J19 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Smim11aQ99J19 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Smim11aQ99J19 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Smim11aQ99J19 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Smim11aQ99J19 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Smim11aQ99J19 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Smim11aQ99J19 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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