Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Top1mtQ8R4U6 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top1mtQ8R4U6 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms