Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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OptnQ8K3K8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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OptnQ8K3K8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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OptnQ8K3K8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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OptnQ8K3K8 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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OptnQ8K3K8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms