Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms