Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssh3Q8K330 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms