Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc12Q8K2L8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms