Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Fcho1Q8K285 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Fcho1Q8K285 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Fcho1Q8K285 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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Fcho1Q8K285 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fcho1Q8K285 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Fcho1Q8K285 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Fcho1Q8K285 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fcho1Q8K285 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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Fcho1Q8K285 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fcho1Q8K285 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fcho1Q8K285 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fcho1Q8K285 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fcho1Q8K285 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fcho1Q8K285 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fcho1Q8K285 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fcho1Q8K285 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fcho1Q8K285 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Fcho1Q8K285 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Fcho1Q8K285 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Fcho1Q8K285 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fcho1Q8K285 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fcho1Q8K285 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fcho1Q8K285 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fcho1Q8K285 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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