Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
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Znf628Q8CJ78 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Znf628Q8CJ78 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Znf628Q8CJ78 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Znf628Q8CJ78 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Znf628Q8CJ78 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Znf628Q8CJ78 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Znf628Q8CJ78 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Znf628Q8CJ78 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Znf628Q8CJ78 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Znf628Q8CJ78 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Znf628Q8CJ78 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Znf628Q8CJ78 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Znf628Q8CJ78 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Znf628Q8CJ78 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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