Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms