Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnka2ipQ8CH19 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms