Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rdh13Q8CEE7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms