Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms