Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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