Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Atg4aQ8C9S8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Atg4aQ8C9S8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Atg4aQ8C9S8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Atg4aQ8C9S8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Atg4aQ8C9S8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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