Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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FarsaQ8C0C7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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FarsaQ8C0C7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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FarsaQ8C0C7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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